2002年3月，經(jīng)重慶市教委批準(zhǔn)，成立了重慶醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系（2011年5月更名為重慶醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院）?，F(xiàn)實(shí)行學(xué)院、超聲醫(yī)學(xué)工程研究所、省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等一體化管理。
重慶醫(yī)科大學(xué)于1990年7月獲生物醫(yī)學(xué)工程碩士學(xué)位授予權(quán)，2003年8月獲生物醫(yī)學(xué)工程博士學(xué)位授予權(quán)（一級學(xué)科，自主設(shè)置了6個(gè)二級學(xué)科）。學(xué)院現(xiàn)有五年制生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)（醫(yī)療器械方向）本科專業(yè)，依托產(chǎn)學(xué)研用平臺，學(xué)院重視學(xué)生創(chuàng)新能力和綜合素質(zhì)培養(yǎng)，學(xué)生畢業(yè)后在醫(yī)工結(jié)合的交叉領(lǐng)域從事醫(yī)療設(shè)備的使用、維護(hù)和管理工作?，F(xiàn)已經(jīng)形成了生物醫(yī)學(xué)工程本科—碩士—博士—博士后完整的人才培養(yǎng)體系。
30余年來，學(xué)院潛心于“高強(qiáng)度聚焦超聲(HIFU)技術(shù)”的工程理論與臨床研究，解決了阻礙HIFU治療技術(shù)發(fā)展的難題，即HIFU在組織內(nèi)聚焦規(guī)律及劑量學(xué)等，首次提出“生物學(xué)焦域”概念等理論。通過對HIFU治療系統(tǒng)的優(yōu)化、生物學(xué)效應(yīng)研究、治療劑量研究、組織聲環(huán)境以及改變組織聲環(huán)境研究等，初步建立了超聲治療的基礎(chǔ)理論體系。初步建成了超聲治療領(lǐng)域?qū)W術(shù)、技術(shù)交流的平臺。經(jīng)過多年的發(fā)展，形成穩(wěn)定的科研方向，包括強(qiáng)聲學(xué)與生物學(xué)效應(yīng)、多模態(tài)影像監(jiān)控與智能精準(zhǔn)治療、超聲治療臨床研究與大數(shù)據(jù)等。
近年來，學(xué)院先后承擔(dān)了100余項(xiàng)國家和地方科研項(xiàng)目，包括國家重大儀器設(shè)備專項(xiàng)、國家973計(jì)劃項(xiàng)目、國家十一五和十二五科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金委重點(diǎn)項(xiàng)目、杰出青年基金項(xiàng)目及多個(gè)面上項(xiàng)目、教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目等國家級項(xiàng)目，已獲準(zhǔn)經(jīng)費(fèi)1億余元。在國內(nèi)外刊物上公開發(fā)表學(xué)術(shù)論文1000余篇，其中SCI論文100篇，主編了《治療超聲原理與應(yīng)用》、《實(shí)用超聲治療學(xué)》、《臨床超聲治療學(xué)》等專著，參編了第四、第五版《超聲醫(yī)學(xué)》HIFU篇章、《現(xiàn)代介入性超聲診斷與治療》、《微無創(chuàng)醫(yī)學(xué)叢書——子宮肌瘤》。已獲2010年國家科技進(jìn)步二等獎、2000年國家技術(shù)發(fā)明二等獎、“九五”國家重點(diǎn)科技攻關(guān)重大科技成果等、2000年重慶市科技進(jìn)步一等獎、2005年重慶市技術(shù)發(fā)明一等獎、2009年重慶市科技進(jìn)步一等獎等。2001年5月，“首屆HIFU在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用國際研討會”在中國重慶召開；2009年10月“首屆超聲無創(chuàng)治療國際高峰論壇”在中國重慶召開；2013-2019年，在中國重慶先后召開了第1-4屆“微無創(chuàng)醫(yī)學(xué)長江高峰論壇”，這標(biāo)志著中國重慶在HIFU領(lǐng)域的基礎(chǔ)和臨床應(yīng)用研究已走在了世界前列。
迄今為止，學(xué)院研制的具有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的“海扶超聲聚焦刀”等系列超聲治療設(shè)備已在全國2000余家醫(yī)院投入使用，并遠(yuǎn)渡重洋落戶德國、英國、日本、韓國、新加坡等26個(gè)國家，成功治療了各類患者200萬余例。
目前，學(xué)院云集了一批多學(xué)科交叉、醫(yī)工結(jié)合的科研隊(duì)伍，擁有國家重大儀器專項(xiàng)首席科學(xué)家1人，973計(jì)劃首席科學(xué)家1人，人事部百千萬人才人選2人，杰出青年基金獲得者1人，全國杰出專業(yè)技術(shù)人才1人、教育部跨世紀(jì)（新世紀(jì)）人才支持計(jì)劃獲得者2人，國際超聲治療學(xué)會常務(wù)理事1人，中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會副理事長1人等高層次人才?，F(xiàn)有博士生導(dǎo)師6名，碩士生導(dǎo)師12名，本科生專業(yè)教師30余名，專業(yè)涉及生物醫(yī)學(xué)工程、腫瘤學(xué)、超聲治療學(xué)、電子學(xué)、計(jì)算機(jī)學(xué)、材料學(xué)、機(jī)械學(xué)等。已培養(yǎng)碩士研究生500余名、博士研究生50名、博士后30名，在校本科生200余名、碩士研究生100名、博士研究生20名、博士后15名。
今天，微無創(chuàng)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域方興未艾，學(xué)院作為超聲治療核心技術(shù)的領(lǐng)跑者和推動者，將以超聲治療技術(shù)為代表的微無創(chuàng)醫(yī)學(xué)事業(yè)發(fā)展做出更大的貢獻(xiàn)！