重慶郵電大學(xué)導(dǎo)師：Henning Hermjakob 正文

[導(dǎo)師姓名]
Henning Hermjakob

[所屬院校]
重慶郵電大學(xué)

[基本信息]
導(dǎo)師姓名：HenningHermjakob
性別：
人氣指數(shù)：996
所屬院校：重慶郵電大學(xué)
所屬院系：
職稱：
導(dǎo)師類型：
招生專業(yè)：

[通訊方式]


[個(gè)人簡述]
國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心（北京）生物信息部部長 （蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室）；英國劍橋歐洲生物信息研究所（EMBL-EBI）分子系統(tǒng)部部長（歐洲分子生物實(shí)驗(yàn)室）。

Henning Hermjakob在歐洲生物信息學(xué)研究所所帶領(lǐng)的分子系統(tǒng)小組，為系統(tǒng)生物學(xué)的研究提供了廣泛的資源，包括從蛋白質(zhì)表達(dá)（PRIDE），分子間相互作用（IntAc）和反應(yīng)途徑（Reactome）到系統(tǒng)生物學(xué)模型（BioModels）。作為HUPO蛋白質(zhì)組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)計(jì)劃的共同主席和創(chuàng)始成員，英國蛋白質(zhì)組學(xué)研究協(xié)會(huì)執(zhí)行委員會(huì)成員（BSPR），蛋白質(zhì)組學(xué)雜志的資深編輯,Henning Hermjakob 致力于蛋白組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的研究。

在鳳凰中心，他領(lǐng)導(dǎo)并帶領(lǐng)著鳳凰中心生物信息平臺(tái)逐步穩(wěn)定發(fā)展。并成立了分子系統(tǒng)課題組。Henning Hermjakob主要研究方向是數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化，數(shù)據(jù)整合，分布式數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，和生物網(wǎng)絡(luò)分析與可視化。

[科研工作]
代表性論文：一共發(fā)表201篇論文，H-index指數(shù)為59，被授予為湯森路透高被引科學(xué)家獎(jiǎng)（在研究領(lǐng)域最高被引1%）
[1]. Griss J, et al. Recognizing millions of consistently unidentified spectra across hundreds of shotgun proteomics datasets. Nat Methods. 2016 Aug13(8):651-656. [2]. Deutsch EW1, et al. Human Proteome Project Mass Spectrometry Data Interpretation Guidelines 2.1. J Proteome Res. 2016 Nov 415(11):3961-3970.[3]. Fabregat A，et al. The Reactome pathway Knowledgebase. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 444(D1):D481-7. [4]. Perez-Riverol Y，et al. PRIDE Inspector Toolsuite: Moving Toward a Universal Visualization Tool for Proteomics Data Standard Formats and Quality Assessment of ProteomeXchange Datasets. Mol Cell Proteomics. 2016 Jan15(1):305-17.[5]. Swat MJ, et al. Pharmacometrics Markup Language (PharmML): Opening New Perspectives for Model Exchange in Drug Development. CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol. 2015 Jun4(6):316-9.[6]. Chelliah V, et al. BioModels: ten-year anniversary. Nucleic Acids Res. 2015 Jan43 (Database issue): D542-8.[7]. Porras P, et al. A visual review of the interactome of LRRK2: Using deep-curated molecular interactions data to represent biology. Proteomics. 2015 Feb 3.[8]. Vizcaíno JA, et al. ProteomeXchange provides globally coordinated proteomics data submission and dissemination. Nat Biotechnol. 2014 Mar 1032(3):223-6.[9]. Orchard S, et al. The MIntAct project--IntAct as a common curation platform for 11 molecular interaction databases. Nucleic Acids Res. 2014 Jan42(Database issue):D358-63.[10]. Griss J, Foster JM, Hermjakob H, Vizcaíno JA. PRIDE Cluster: building a consensus of proteomics data. Nat Methods. 2013 Feb10(2):95-6.[11]. Orchard S, et al. Protein interaction data curation: the International Molecular Exchange (IMEx) consortium. Nat Methods. 2012 Mar 279(4):345-350.[12]. Wang R, et al. PRIDE Inspector: a tool to visualize and validate MS proteomics data. Nat Biotechnol. 2012 Feb 830(2):135-7. doi: 10.1038/nbt.2112.

[教育背景]
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