2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書(shū)目

發(fā)布時(shí)間:2021-09-02 編輯:考研派小莉 推薦訪問(wèn):
2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書(shū)目

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2022年重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)院碩士研究生考試《生物信息學(xué)》大綱及參考書(shū)目 正文

《生物信息學(xué)(F052)》考試大綱》
命題方式 招生單位自命題 科目類別 復(fù)試
滿分 100
考試性質(zhì)
復(fù)試科目
考試方式和考試時(shí)間
閉卷
試卷結(jié)構(gòu):
名詞解釋(20%);填空題(20%);分析題(30%);綜合題(30%);括號(hào)為題型大約占據(jù)的百分比。以實(shí)際考題為準(zhǔn)。
考試內(nèi)容和要求
1、生物信息學(xué)概念及其發(fā)展歷史:了解生物信息學(xué)發(fā)展歷史、主要研究領(lǐng)域和主要應(yīng)用;理解并掌握生物信息學(xué)的概念。了解生物信息學(xué)發(fā)展面臨的主要問(wèn)題和研究生物信息學(xué)所掌握的主要技能。掌握生物信息學(xué)   的常用網(wǎng)站 NCBI 等搜索生物信息學(xué)工具的方法。
2、生物數(shù)據(jù)庫(kù)及其檢索:了解生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容和結(jié)構(gòu);了解生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)格式;掌握生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索方法。熟悉常用的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。
3、序列比對(duì)原理及應(yīng)用:了解雙序列比對(duì)和多序列比對(duì)的概念;掌握常用的核酸和蛋白質(zhì)打分矩陣;了解雙序列比對(duì)算法。了解多重比對(duì)算法,掌握常用的序列比對(duì)工具的使用方法。
4、基因組注釋:了解蛋白質(zhì)編碼基因、重復(fù)序列和假基因的注釋方法。掌握 RNA 基因注釋方法。了解一種真核生物基因組注釋的案例。
5、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析與預(yù)測(cè):了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)組織層次;掌握蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的常用方法;理解蛋白質(zhì)對(duì)接和分子對(duì)接。了解與蛋白質(zhì)折疊相關(guān)的疾病。
6、蛋白質(zhì)組分析:了解蛋白質(zhì)的大規(guī)模分離鑒定技術(shù)簡(jiǎn)介;掌握串聯(lián)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)組方法及蛋白質(zhì)組學(xué)概念。了解蛋白質(zhì)的翻譯后修飾和分選的方法大規(guī)模分離鑒定技術(shù)簡(jiǎn)介;掌握蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)研究方法。 
7、轉(zhuǎn)錄組分析:了解轉(zhuǎn)錄組基本概念及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法。掌握轉(zhuǎn)錄組分析的基本原理、方法和分析內(nèi)容。   掌握一個(gè)轉(zhuǎn)錄組分析的案例。
8、非編碼 RNA 分析:了解非編碼 RNA 的分類;了解 miRNA 的生物合成和生物信息學(xué)分析方法。
9、分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育:了解分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育的概念;掌握幾種基于距離的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)構(gòu)建方法。了解最大似然法、最大簡(jiǎn)約法和貝葉斯方法的原理;了解基于全基因組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)構(gòu)建方法。了解系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)構(gòu)建的應(yīng)用;掌握 Mega 軟件使用方法。
10、聚類算法及其應(yīng)用:掌握基因表達(dá)分析基本概念;熟悉系統(tǒng)聚類基本概念;掌握 k-均值聚類算法基本思想;熟悉進(jìn)化樹(shù)與系統(tǒng)聚類(UPGMA 算法)
11、隱馬爾科夫模型及其應(yīng)用:了解 CG 島和“公平賭場(chǎng)”問(wèn)題;掌握公平賭場(chǎng)和隱馬氏模型基本概念; 了解解碼算法;熟悉隱馬氏模型參數(shù)估計(jì)。
12、機(jī)器學(xué)習(xí)及其應(yīng)用:掌握機(jī)器學(xué)習(xí)的概念,了解經(jīng)典的機(jī)器學(xué)習(xí)算法。
13、新一代測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用: 了解測(cè)序技術(shù)的發(fā)展過(guò)程;掌握第二代測(cè)序技術(shù)原理;了解第三代測(cè)序技
術(shù);了解新一代測(cè)序技術(shù)在生物學(xué)研究中的應(yīng)用。
參考書(shū)目
1、《生物信息學(xué)》(第 3 版)陳銘,科學(xué)出版社
2、《生物信息學(xué):序列與基因組分析(英文版)》David W. Mount,科學(xué)出版社
備注
 
重慶郵電大學(xué)

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